Estudio retrospectivo sobre el impacto operativo del proceso de desarrollo de la biblioteca Accugenix para el rendimiento de MALDI-TOF.
¿Qué tan importante es la biblioteca que se utilice para las identificaciones microbianas?
Resúmen: Las actualizaciones frecuentes de la biblioteca Accugenix se priorizan según la frecuencia de aparición de bacterias en las instalaciones de producción. Esto genera una tasa de responsabilidad a nivel de especie mucho mayor que la de los sistemas MALDI-TOF de la competencia y tiene un impacto positivo en las operaciones y la capacidad de generación de informes de las instalaciones. Además, tanto en el sistema Axcess como AccuPRO-ID, se realiza la identificación de cualquier caso desconocido que no permita la identificación, sin coste adicional para los clientes. Mediante la secuenciación del ADNr 16S, AccuGENX-ID, se centra en estos aislamientos para el desarrollo continuo de la biblioteca de referencia MALDI-TOF. Como marco de referencia, Charles River ha ampliado la base de datos de la biblioteca con más de 1600 entradas, para un total combinado de aproximadamente 7200 entradas. En promedio, se realizan actualizaciones de mantenimiento de la biblioteca cada 2 a 4 semanas. Esto significa que si falta una especie, se puede agregar mucho más rápidamente. Al ser responsables de este proceso, los clientes ahorran tiempo y dinero al no tener que comprar, actualizar ni validar estas actualizaciones. Y lo más importante, con Charles River Accugenix los clientes pueden estar seguros de que su entorno de fabricación está controlado por la calidad con datos de las bibliotecas de identificación más completas y precisas de la industria.
Introducción: Lo que realmente importa operativamente para el microbiólogo industrial es la capacidad de determinar una identificación que refleje la amplia diversidad de muestras bacterianas presentes en las instalaciones de producción. ¿Ofrece la biblioteca del sistema una amplia cobertura (número de especies) y especies relevantes (las encontradas en producción) para generar un informe preciso a nivel de especie? Dado que Charles River ha desarrollado una estrategia para añadir especies, basándose en las muestras más frecuentes que no permiten la identificación a nivel de especie, evaluamos continuamente el impacto operativo que nuestras bases de datos tienen para el microbiólogo de control de calidad en los informes de identificación.
Métodos: Se realizó un estudio retrospectivo basándose en muestras recolectadas de un centro de fabricación de vacunas, durante 4 años se lograron identificar 5942 muestras con la biblioteca y el servicio Accugenix. De estas 5942 el 82,3% se clasificaron hasta especie, el 5% especie* (*cuando dos microorganismos están filogenéticamente demasiado cerca), 10,4% género, 1,5% familia, 0,8% orden y 0,02% clase. Se compararon las identificaciones a nivel especie obtenidas con Accugenix contra a otros sistemas MALDI-TOF comerciales, evaluando la capacidad de estos sistemas para identificar muestras desconocidas según la capacidad y diversidad de la biblioteca.
Resultados: Del total de identificaciones a nivel de especie, se lograron identificar 519 especies únicas. Se compararon los resultados con otras bibliotecas MALDI-TOF del mercado, concluyendo que con Accugenix se obtuvo una cobertura del 86,3% de estas especies, en comparación con las otras bibliotecas que sólo dieron una cobertura del 50,7% y 31,6%, lo que indica un resultado más confiable. Adicionalmente, el 55,9% de las especies identificadas, eran nombres exclusivos de la biblioteca Accugenix.
Conclusión: Con Accugenix de Charles River, los clientes pueden estar seguros de que su entorno de fabricación está controlado por la calidad de los datos de las bibliotecas de identificación más completas y precisas de la industria.
